摘要:芽殖酵母Sch9與哺乳動物S6K1是保守的壽命調(diào)控同源蛋白,利用生物信息學(xué)手段比較分析了Sch9與S6K1的理化性質(zhì)、亞細(xì)胞定位、信號肽和跨膜區(qū)、空間結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)、序列同源性及進(jìn)化關(guān)系,以期對Sch9與S6K1的結(jié)構(gòu)功能的深入研究提供線索和基礎(chǔ)。結(jié)果表明Sch9為酸性穩(wěn)定性親水蛋白,而S6K1為酸性不穩(wěn)定的親水蛋白,均無信號肽和跨膜區(qū)域,兩者定位于細(xì)胞核的可能性最大。Sch9與S6K1的主要二級結(jié)構(gòu)均為無規(guī)卷曲,在進(jìn)化上相當(dāng)保守,Sch9屬于C2超家族和PKclike超家族,S6K1屬于PKclike超家族。Sch9相互作用蛋白主要有Cyr1、Tor1、Tor2、Pkh1/2,而S6K1相互作用蛋白主要有PIK3CA、RHEB、Rps6、RPTOR、mTOR,顯示兩者的相互作用蛋白保守性也較強(qiáng)。同時,分析顯示Sch9與S6K1均具有利于蛋白間相互作用的結(jié)構(gòu)特點,為進(jìn)一步深入研究Sch9與S6K1的分子功能及調(diào)控機(jī)制提供了一定的理論參考。
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生物信息學(xué)雜志, 季刊,本刊重視學(xué)術(shù)導(dǎo)向,堅持科學(xué)性、學(xué)術(shù)性、先進(jìn)性、創(chuàng)新性,刊載內(nèi)容涉及的欄目:綜述、研究論文等。于2003年經(jīng)新聞總署批準(zhǔn)的正規(guī)刊物。